自然科学には「目の前に現存する試料しか解析できない」という当たり前ですが、難儀な制約があります。生物学においても、個体や組織レベルの分子・細胞プロファイルを得る際には対象を破壊しなくてはならないので、その時点でのスナップショットの情報しか得られません。この問題に取り組むために、特定の形質を示すことが観察された細胞クローンと同じものをその形質が示される前の生命システムから単離する「遡及的クローン単離
(retrospective clone isolation)」技術の開発を推進します。特定の運命を持つ細胞を調べたり、解析したりできる技術を開発し、マウスの発生および造血過程の分化トラジェクトリーを調べつつ、脊椎動物種の比較ゲノム解析によって、ゲノム変化(トランスポゾン)が細胞分化と進化にもたらすインパクトと可塑性について調べます。